Kuna paljud säilitushaigused avalduvad hoidlas esimese kahe kuu jooksul, tasub vähemalt esialgu käia kord kuus õunu sorteerimas.

Hoiustatud ubinaid rikuvad kõige enam õunapuu-kärntõbi, mis säilitusperioodil tekitab laokärna; puuvilja-, lao- ja mustmädanik. Harvem esineb hahk-, nutt- ja rohehallitust.

Õunapuu-kärntõbi on vilja pinnal väikeste mattmustade laikudena nähtav juba puu otsas. Eriti vastuvõtlikud sordid on ‘Cortland’ ja ‘Lobo’, aga ka ‘Tartu roosõun’, ‘Krügeri tuviõun’, niisketel suvedel ‘Antonovka’, ‘Tiina’, ‘Tellissaare’.